EpiAqua 2026 fortalece el liderazgo de INCAR² en genómica, microbiota y salud de especies acuícolas en el Centro de Biotecnología

EpiAqua 2026 fortalece el liderazgo de INCAR² en genómica, microbiota y salud de especies acuícolas en el Centro de Biotecnología

El Centro de Biotecnología de la Universidad de Concepción fue el epicentro de la epigenómica acuícola con la realización de EpiAqua 2026, instancia que reunió a estudiantes de postgrado, investigadores jóvenes y referentes internacionales para profundizar en los avances más recientes de la epigenómica aplicada a la acuicultura. El curso, organizado por el Centro de Investigación Aplicada INCAR² y COPAS Coastal, consolidó al CB-UdeC como un espacio estratégico para la formación avanzada y la articulación de ciencia de frontera con desafíos productivos y ambientales.

Durante dos intensas jornadas desarrolladas el 26 y 27 de enero, una veintena de participantes se sumó a un programa que combinó charlas magistrales, talleres prácticos y presentaciones científicas, en un entorno que favoreció el intercambio directo con especialistas y el trabajo con tecnologías de última generación.

La apertura contó con la participación del académico de la Universidad de Washington, Dr. Steven Roberts, quien dictó la charla “Shellfish Environmental Memory Beyond Epigenetics”, donde abordó el rol de la epigenética en la adaptación de organismos marinos frente al cambio climático y su proyección en programas de restauración:

“La epigenética es una herramienta vital para entender cómo se adaptan los organismos acuáticos, especialmente en escenarios de cambio climático, contribuyendo así a la restauración de diferentes organismos”, señaló.

El componente formativo tuvo un fuerte énfasis práctico gracias a los Genomic Boot Camp, que se desarrollaron en dependencias del Centro de Biotecnología UdeC y laboratorios de INCAR². En la primera jornada, la Dra. Yeny Lealguió el taller “Herramientas de Visualización NGS”, donde se trabajó con plataformas como Idep y ShinyGO para el análisis funcional e interpretación biológica de datos transcriptómicos:

“El uso complementario de Idep y ShinyGO permite comparar estrategias de análisis funcional y reforzar la interpretación biológica de los resultados transcriptómicos”.

Uno de los hitos fue el Camp Boot de Secuenciación Nanopore realizado en el Laboratorio de Biotecnología y Genómica Acuícola del CB-UdeC/INCAR², dirigido por la Dra. Valentina Valenzuela Muñoz, investigadora principal del centro. Allí, las y los estudiantes trabajaron directamente con las plataformas MinION y PromethION, conociendo sus diferencias operativas, rendimiento y tipos de librerías.

“A través del trabajo práctico en el laboratorio mostramos las diferencias entre las dos plataformas que nosotros tenemos, MinION y PromethION, para que puedan conocer las características de cada equipo, su rendimiento y las librerías que se pueden utilizar en cada uno”, detalló.

La segunda jornada estuvo marcada por el conocimiento de excelencia y el protagonismo de los nuevos talentos. El académico de la University of Wisconsin Milwaukee, Dr. Rick Goetz, abrió el día con la charla “Asessing heritable phenotypic variation in Lake Charr ecomorphs”, donde presentó dos décadas de investigación en epigenética vinculada a procesos de evolución y restauración ecológica:

“En este caso, la epigenética nos ha permitido comprender la evolución de los peces. No entendemos cómo evolucionaron algunos peces, pero estos ecomorfos que describí probablemente están atravesando un proceso de evolución. Y comprender la genómica de eso nos permitiría formular algunas hipótesis sobre cómo están evolucionando”, comentó.

El liderazgo científico de INCAR² tuvo un lugar central en el programa. La Dra. Valentina Valenzuela Muñoz presentó la charla “Epigenetic and Transcriptomic approach to understanding the Atlantic salmon response to Caligus rogercresseyi infestation”, donde expuso cómo la integración de epigenética y transcriptómica permite comprender la respuesta del salmón frente a este parásito, con aplicaciones directas para la industria.

“El uso de esta herramienta permite complementar a los programas de selección de familias que se utilizan en la industria y a través de estas herramientas utilizar marcadores genómicos”, explicó.

En la misma línea, el investigador de INCAR², Dr. Diego Valenzuela Miranda, presentó “Understanding the importance of Microbiota in phenotypic variations”, destacando el papel de la microbiota en la modulación epigenética y en la expresión del fenotipo.

“La epigenética es una rama que lleva años desarrollándose y que se ha visto muy beneficiada por el desarrollo de tecnologías de secuenciación masiva de tercera generación. Entonces estamos en un momento donde tenemos muchas preguntas sobre cómo el fenotipo del organismo es determinado y estamos en un momento muy preciso para incorporar estas nuevas tecnologías para tratar de dar nuevas soluciones para la acuicultura”, afirmó.

El programa incluyó además la presentación “Sea Lice Epigenomics”, a cargo del director de INCAR², Dr. Cristian Gallardo Escárate, quien abordó el uso de la epigenómica para enfrentar el impacto del Caligus en la salmonicultura.

“La epigenómica está cada vez ganando más importancia y actualmente hay tecnologías que permiten estudiar y entender cómo se adaptan los recursos genéticos. Actualmente estamos tratando de entender los mecanismos que son importantes para la determinación sexual en Caligus, un área que queremos desarrollar desde INCAR como una alternativa de control a través de la edición génica experimental”, indicó.

EpiAqua 2026 también abrió un espacio para que jóvenes investigadores y estudiantes presentaran voluntariamente sus proyectos, generando un diálogo científico enriquecedor y retroalimentación especializada. Hacia el cierre, el director de INCAR² valoró la alta participación y el compromiso de la comunidad.

“Agradezco la participación, el entusiasmo y el interés por ser parte de EpiAqua 2026. Esta energía confirma la necesidad de seguir impulsando espacios de formación avanzada y colaboración, por lo que ya proyectamos una tercera versión para 2028”, concluyó el Dr. Cristian Gallardo Escárate.

Con esta iniciativa, el Centro de Biotecnología UdeC refuerza su rol como plataforma de articulación entre investigación de excelencia, formación de capital humano avanzado e innovación para una acuicultura más sostenible, mientras que INCAR² consolida su liderazgo en epigenómica y genómica aplicada a los principales desafíos sanitarios, productivos y ambientales del sector.