El grupo de Microbiología Ambiental, se ha centrado principalmente en el estudio y aplicaciones biotecnológicas de las biopelículas (biofilms), para el tratamiento biológico de efluentes y superficies industriales, acuícolas, y de otros ámbitos de la economía regional.

En particular, el grupo trabaja en biorremediación de suelos y sedimentos mediante barreras biológicas, en el control de biopelículas mediante adherencia microbiana y formación de biopelículas de importancia industrial (biocorrosión), en control de fitopatógenos para el sector agroforestal, y el control de fouling y patógenos de peces. Además de ecología molecular y
expresión génica en biopelículas, con enfoque en la caracterización química y actividad biológica de moléculas naturales con actividad de moduladores transcripcionales en procariontes.